Тем не менее, снижение темпов и неудовлетворительная реализация реформ в начале 2000-х годов не позволили Кыргызской Республике сохранить высокие темпы роста. В 2000-х годах были проведены некоторые реформы в сфере регулирования, включая реформы, способствующие выходу на рынок, регистрации собственности и внешней торговле, наряду с реформами в области налоговой политики, однако прогресс в рамках "второго поколения реформ" – реструктуризация предприятий, улучшение конкурентной среды, квалификации рабочей силы и основного капитала, – был ограниченным, тогда как государственное управление в целом ухудшилось, что подтолкнуло к революциям в 2005 и 2010 гг.. В результате, значительная часть частного сектора осталась, большей частью, в неформальном секторе, усилия по привлечению инвесторов оказались, в основном, безуспешными, из страны мигрировало около 15 процентов рабочей силы, а качество государственных услуг ухудшилось. В период с 2000 по 2010 годы совокупное значение средних темпов роста составляло всего лишь 4,1 процента, по сравнению с 5,4 процента в регионе Европе и Центральной Азии, причем с растущей зависимостью экономического роста от одного золотого рудника, денежных переводов трудовых мигрантов и неформального реэкспорта.

Последние события являются более многообещающими и, наряду с относительно благоприятными экономическими перспективами региона в целом, обеспечивают широкие возможности для Кыргызской Республики. Государственное управление является одним из основных приоритетов работы, проводимой всеми составами правительства после 2010 года, и, несмотря на низкий исходный уровень, прогресс был достигнут по большинству показателей в области управления с 2009 года (за исключением политической стабильности). Программе реформ придан новый импульс – прогресс достогнут в области лицензирования, проверок и внешней торговли, наряду с реализацией ряда крупномасштабных инвестиций – особенно, в сфере транспорта и энергетики. Вместе с тем, рост ВВП был нестабильным из-за целого ряда потрясений, включая смещение ледника на главном золотом месторождении страны, что привело к сокращению ВВП на 0,1 процента в 2012 году, с последующим восстановлением на 10,5 процента в 2013 году – после того, как возобновилось производство золота в нормальном режиме. Обнадеживающим является то обстоятельство, что на протяжении вот уже трех лет экономика – без учета золота – расширяется в диапазоне 5-6 процентов в год за счет стабильных денежных переводов трудовых мигрантов, увеличения объемов кредитования частного сектора, увеличения объемов государственных инвестиций и восстановления туризма, что служит поддержке экономической активности.